含磷废水中的除磷通常有物理化学脱磷、生物除磷处理工艺和吸附法，以及物理化学除磷和生物除磷处理联合使用，具体如下。

1、物理化学脱磷

（1）化学沉淀法

化学沉淀法除磷主要指应用钙盐，铁盐和铝盐等产生的金属离子与磷酸根生成难溶磷酸盐沉淀物的方法来去除废水中的磷。最常用的是石灰、硫酸铝、铝酸钠、三氯化铁、硫酸铁、硫酸亚铁和氯化亚铁。

（2）化学絮凝法

化学混凝法除磷是将可溶性磷转化为悬浮性磷，并将其滞留。水中的磷大部分是溶解状的无机化合磷，主要是洗涤剂的正磷酸盐和稠环磷酸盐，其余小部分是以溶解和非溶解状态存在的有机化合磷。

该法脱磷特点：该法磷的去除率在75%左右，处理效果稳定，系统操作易于自动化。但由于人为投加了化学药剂,一方面产生大量的污泥难于处理，另一方面又造成水处理费用的增高。

（3）结晶法

结晶法除磷是利用污水中磷酸根离子与钙离子以及氢氧根离子反应生成羟基磷灰石(Hydroxyapatite)的晶析现象。在作为晶核的除磷剂上析出羟基磷灰石，从而达到除磷的目的。因此，作为晶核的除磷剂绝大多数都是含钙的矿物质材料,如磷矿石、骨炭、高炉铁渣等，但以磷矿石和动物骨灰效果为最好，也可使用多孔材料为载体，利用非均相及二次成核作用在载体表面培养一层羟基磷灰石晶体，作为后续除磷的初级晶种。

该法脱磷特点：采用结晶法除磷时，磷在晶核表面析出，因此仅仅是晶核变大，处理过程中产生的污泥量比化学沉淀法少得多，且析出的羟基磷灰石可用于磷的回收。该法投资省，出水水质好， 在常规活性污泥法的改造中具有普遍的适用性，是一种可靠的含磷废水的深度处理方法。但结晶法要求进水呈碱性(pH>8)，且需一定的钙离子浓度。